Клан Учиха когда-то был сильнейшим кланом и являлся, на ряду с кланом Сенджу, одним из кланов-основателей Конохи. Члены клана обладали необычайным объемом чакры и Шаринганом. Клан располагал собственным кварталом в деревне и формировал полицию Конохи. На текущий момент известны два живых члена клана: Саске и Сарада.

После нападения девятихвостого лиса на Коноху, лидеры деревни заподозрили клан в планировании переворота. Лидеры пришли к выводу, что лишь представитель Учих мог управлять девятихвостым. Учиха действительно планировали захват деревни, однако нападение Кьюби, по словам Мадары , было природным явлением. Позже, за пять лет до начала основного сюжета, лучший друг Итачи, Учиха Шисуи, отдает тому свой глаз, опасаясь, что Данзо отберет у него их оба. Итачи и Шисуи работали на Анбу в паре, но Данзо никогда не доверял Шисуи. Итачи становится третьим известным обладателем проклятого Шарингана. К тому времени Итачи уже считался одним из самых талантливых представителей клана за всю историю, и вместе с его положением в деревне, усиливалось его высокомерие. Итачи был послан Учихами в Анбу в качестве шпиона. Но те использовали Итачи как шпиона внутри клана Учиха, что делало его двойным агентом. Позже, Шисуи доложил Хокаге о том, что клан Учиха готовит переворот, Шисуи предложил наложить на клан гендзюцу, но Данзо вырвал у него правый глаз, а свой левый глаз Шисуи отдал Итачи. Не найдя другого выхода, Хирузен приказал Итачи убить весь клан. Итачи убил всех кроме Саске
Индра — старший сын Хагоромо Ооцуцуки унаследовал от него его "глаза" и особенную чакру. Он считал, что мир состоит из сражений и ненависти. Этот сын - основатель клана Учиха. Хагоромо передал путь Ниншу младшему брату, что оскорбило Индру и дало ему повод развязать с ним войну.

80 лет назад братьям Мадаре и Изуне Учиха первым удалось пробудить Мангекьё Шаринган. Мадара слишком часто подвергал свой Шаринган напряжениям и почти ослеп. В этот момент его младшей брат Изуна был смертельно ранен Сенджу Тобирамой. После смерти последнего брата, Мадара пересадил его глаза себе дабы не ослепнуть окончательно, так он и получил Вечный Мангекьё Шаринган. С этой новой силой ему удалось подчинить любой клан, который вставал на его пути.