背景故事

2006年8月10日，JDFI进入长野研究，与高田合作，改造住宅变成实验室。
2007年5月2日，次元波动。高田死亡，片山惠子失踪。夏美被送去孤儿院。
2007年5月6日，南川化名鲁加入JDFI复仇。
2008年3月6日，南川干掉两个研究员逃离。
2008年3月20日，南川故意入狱，靠日本警方躲避JDFI追捕。
2010年3月，纯二因资金不足中断研究。
2010年6月2日，纯二向千绪父母借钱。
2010年7月5日，纯二贷款。资金筹备成功。
2010年9月6日，特效药研制成功。
2010年11月19日，明日香去世。
2010年12月1日，南川被释放 。和纯二达成合作。
2010年12月16日，纯二和南川绑架世界1千绪，跳窗失踪。世界3千绪（2012年3月14日的千绪因错误方式走出北巷，所以她探索完相位之屋后误入世界1）被纯二撞死。恰巧世界2千绪回世界1的家。
2010年12月20日，JDFI废弃区域和实验室人员撤离。
2011年1月，JDFI给纯二贷款。
2011年1月8日，仓品株式会社购买实验设备。
2011年2月10日，纯二申请使用JDFI探测器。招募纱织，绑架纱织妹妹，逼迫纱织参与实验。
2011年3月9日，纯二和南川制造火灾。千绪父母为救千绪牺牲。
2011年3月，明也误入北巷，还到了沙漠里，最终成功逃出，但是下落不明。
2011年3月15日，纯二通过千绪家保险柜的钱还上债务。
2011年3月17日，千绪生日。
2011年4月10日，千绪小满明也解决校园霸凌事件被叫家长。纯二此时去了矿山使用粒子对撞机，被迫返回日本。

游戏开始

①千绪借钱买完可乐饼直接回家。小满一个人走路回家，经过旧屋看到南川从里面出来，跟随发现南川与纯二在长野公园碰面，被两人发现枪杀了。

②千绪在南巷遇到明也询问粉毛火灾的事情，遇到了刚从旧屋出来的纱织和错过巴士的小满。在三人一起回小满家时遇到南川。明也收到世界1侦探电话，赶回世界2。千绪跟随回到世界2。

③下午7点左右，千绪从北巷出来受大原侦探委托调查照片上的纯二，在长野公园听到纯二电话谈及德尔塔计划。后在南巷跟随纯二时被南川击晕带走做实验。

④下午7点左右，千绪从北巷出来，拒绝侦探。遇到小满，小满错过巴士，和千绪一起走路回家。经过旧屋看到南川。南川杀害小满，千绪靠北巷地形反杀南川。

⑤千绪在女厕睡着，醒来听到纯二打电话。千绪和小满一起回家，在商业街遇到纯二。

⑥千绪探查旧屋，遇到市村纱织和南川谈话。之后南川应该与纯二电话沟通，纯二要求杀了知情人。南川绑架纱织妹妹，要挟纱织把千绪带到西巷杀害。纱织挡刀。明也赶到，南川逃跑。最终抓住南川。

千绪和秋月记者收集南川证据，南川坐牢。纯二先杀害知道真相的大原侦探，接着上门杀害了千绪。

明也把纯二送入警察局。千绪离开世界1。小满联合其他人处分了霸凌者。

2010年3月，纯二资金不足中断研究。
2010年6月2日，纯二向千绪父母借钱。
2010年7月5日，纯二贷款。资金筹备成功。
2010年9月6日，特效药研制成功。
2010年11月19日，明日香去世。
2010年12月16日，千绪失踪。
2010年12月，明也听到小女孩歌声进入北巷，知道了平行时空的秘密。开始往返于世界1和2。
2012年3月11日，小满被霸凌致死。
2012年3月14日,大原侦探在北巷遇到意外回归原世界的千绪，两人均被南川枪杀 （世界2的纯二依旧在研究德尔塔计划，但不认识南川）
2012年3月15日，南川被抓入狱。
2012年3月18日，在世界1把纯二送警察局后，千绪回到世界2。